灌肠与打针是两种方法，谈不上哪个危害更大。中医、西医都有自己的灌肠方法，灌肠可以对肠道内局部产生治疗作用，而对全身反应较小。但是灌肠时如果手法不熟练，插入深度过深，患者配合不好，灌肠有可能对局部黏膜产生损伤，甚至是穿孔。所以灌肠一定要在医生指导之下，由经验丰富的操作员来完成，否则对局部的物理创伤要比其他化学反应危害更大。

打针是民间的一种说法，包括静脉输液、肌注、皮下等方式，它的用药方式是针对全身进行治疗。所以取决于它使用的药物种类，打针本身对机体并没有特殊的损伤。如果使用了一些损伤肝、肾、听力以及其他方面的药物，就可能产生相应的副作用，但这和打针本身并没有直接的关联。所以灌肠和打针只是两种方式，谈不上哪一种危害性更大，取决于操作的方式以及使用的药物。